La carta da imballaggio è un materiale poroso; la sua struttura fondamentale è costituita da fibre vegetali e additivi ausiliari, che gli conferiscono forti proprietà idrofile. Se esposta all'umidità, la carta subisce deformazione; nei casi più gravi, possono sviluppare macchie di muffa e durante lo stoccaggio è soggetto a scolorimento e a riduzione della resistenza alla trazione.
I magazzini di stoccaggio devono essere mantenuti asciutti e i livelli di umidità ambientale devono essere rigorosamente controllati. Quando si impila la carta, è necessario sollevarla utilizzando traversine di legno-posizionate a circa 25 mm dal pavimento-e mantenute a una distanza dalle pareti. Dovrebbero essere mantenuti spazi sostanziali tra i pallet per facilitare un'adeguata ventilazione. Una volta impilati, la carta e i pallet devono essere avvolti insieme in modo sicuro utilizzando una pellicola estensibile. L'inventario deve essere ispezionato periodicamente-prestando particolare attenzione alle condizioni degli ultimi-pallet più-e il principio "First-In, First-Out" (FIFO) deve essere rigorosamente rispettato per prevenire il deterioramento della carta causato da una conservazione prolungata. Durante l'utilizzo-in particolare dopo il taglio o durante il processo di stampa-tutti i ritagli di carta rimanenti o i supporti non utilizzati devono essere immediatamente avvolti in una pellicola estensibile per proteggerli dall'umidità.
Durante il trasporto di articoli fragili, la carta da imballaggio stropicciata può essere utilizzata come materiale di riempimento dei vuoti-per occupare gli spazi vuoti all'interno del contenitore di spedizione, prevenendo così lo spostamento degli articoli e i graffi sulla superficie [16]. Anche le scatole di cartone realizzate con carta da imballaggio richiedono protezione dall'umidità; inoltre, dato il loro basso punto di accensione, durante lo stoccaggio devono essere osservate particolari precauzioni antincendio. Le scatole di cartone destinate all'imballaggio alimentare non devono essere riutilizzate, poiché ciò rischia la proliferazione batterica e compromette la sicurezza alimentare.